Arquitectura de datos para la caracterización y análisis de microorganismos multirresistentes

Abstract

En el ámbito sanitario existen una serie de necesidades bioinformáticas insatisfechas, el volumen de los datos sigue creciendo y las plataformas existentes son incapaces de extraer suficiente valor de éstos. El objetivo de este trabajo es valorar los procesos del laboratorio de microbiología del Hospital Universitario de Gran Canaria Doctor Negrín, desarrollar una plataforma de datos basada en Big Data y una aplicación para la generación de informes de vigilancia epidemiológica. La plataforma de datos es desarrollada en Java usando el framework Intino, la generación de informes se realiza en Python haciendo uso de librerías de análisis de datos como Pandas o NumPy.

In the health field there are a number of unmet bioinformatics needs, the volume of data continues to grow and existing platforms are unable to extract sufficient value from the data. The aim of this work is to evaluate the processes of the microbiology laboratory of the Hospital Universitario de Gran Canaria Doctor Negrín, to develop a data platform based on Big Data and an application for the generation of epidemiological surveillance reports. The data platform is developed in Java using the Intino framework, the generation of reports is done in Python using data analysis libraries such as Pandas or NumPy.