Abundance and diversity of marine microbial eukaryotes

Abstract

Microeukaryotes are important ecological players in any kind of ecosystem, most notably in the ocean, and it is therefore essential to collect information about their abundance and diversity. To achieve this general goal this thesis was structured in two parts. The first part represents an effort to define our “diversity unit” from studies based on the well-known cloning and Sanger sequencing approach. Basically, we wanted to establish a solid baseline for the second part of the thesis. We started with data from one cruise (Chapter 1) and then continued with the analysis of the complete dataset of 18S DNA sequences available at that time (Chapter 2).

Los Microeucariotas son actores ecológicos importantes en cualquier tipo de ecosistema, sobre todo en el océano, por lo que es esencial recopilar información acerca de su abundancia y diversidad. Para lograr este objetivo general esta tesis se ha estructurado en dos partes. La primera parte representa un esfuerzo para definir nuestra “unidad de diversidad”, empezando por estudios basados en la clonación molecular y la secuenciación de Sanger. Básicamente, queríamos establecer una base sólida para la segunda parte de la tesis. Empezamos con los datos de una campaña (Capítulo 1) y luego seguimos con el análisis del conjunto completo de datos de secuencias de 18S ADNr disponibles en ese momento (Capítulo 2).